La programmation du Mémorial s'organise principalement autour des expositions temporaires annuelles. Elle se compose d'un volet culturel composé d'expositions, conférences, projections, spectacles et événements artistiques mais aussi d'un calendrier mémoriel et de différentes cérémonies qui rythment la vie du Mémorial tout au long de l'année.
La programmation culturelle complète est disponible directement sur la page actualités du Mémorial.
Les cérémonies sont également annoncées dans l'agenda du Mémorial mais également dans le calendrier commémoratif ci-dessous :
27 janvier : journée internationale dédiée à la mémoire des victimes de l'Holocauste et à la prévention des crimes contre l'humanité
27 mai : journée nationale de la Résistance
18 juin : journée nationale de commémoration de l'Appel du 18 juin 1940
24 août : anniversaire de la libération de la prison de Montluc
